本學科治療項目涵蓋範圍頗廣，包括肺、食道、肋膜、氣管、縱隔腔、橫膈以及胸壁疾病等，致力於先進的達文西及胸腔內視鏡微創手術之發展，秉持著以病患為中心的理念為民眾服務，全科同人致力於推廣及精進胸腔癌、含肺癌、食道癌及縱隔腔腫瘤之診治，特別著重肺癌之預防、早期診斷及治療新觀念及方式之推展及相關研究。
(一)宗旨：
推動"全人照護"的胸腔外科疾病之預防與治療。
(二)理念：
強調以病人為中心的醫療照護。
(三)目標：
在胸腔外科醫學的領域，將基礎醫學的學理應用於臨床醫學上，以視病猶親的態度來服務病人，以最先進之醫療技術及視病猶親的態度落實全人照護之理念。
二、學科特色
積極發展三院特色醫療，整合管理資源、加強臨床知識技能之交流，定期舉辦三院聯合討論會，發展創新技術提高臨床服務，教學成效及研究之競爭力。
醫療特色則涵蓋達文西微創手術(含肺癌、食道癌、縱隔腔腫瘤切除)，肺癌篩檢及早期肺癌精準亞肺葉切除，食道功能性疾病之診斷及微創手術治療，肺腫瘤冷凍治療，單孔胸腔鏡手術，微創肋膜腔溫熱療法及肺臟移植等先進技術之發展。
教育訓練方面，學科內所有專任主治醫師亦肩負台北醫學大學醫學系學生及畢業後一般醫學訓練(post graduate year 1 and 2; PGY1,2)之胸腔外科臨床教學訓練以及住院醫師之專科醫師訓練教學之任務；台北醫學大學所屬三家教學醫院均為台灣胸腔及心臟外科學會所認可之胸腔外科專科訓練醫院。
三、研究重點
肺癌、食道癌、縱隔腔腫瘤之分子病理生物標記及腫瘤微環境之相關研究，各種胸腔術式與臨床結果相關性分析，外科模擬教學訓練成效分析，臨床問題之統合分析(meta-analysis)等。